S:t Nicolai Gille instiftades den 6:e mars 1917 till åminnelse av tidigare gillen vid Stadskyrkan i Stockholm.

Ett medeltida gille Sancti Nicolai Gille omnämndes i Stockholm stads tänkebok 1483. I Olai Petri tänkebok omtalas, att vid en sammankomst år 1528, en fråga om Sancti Nicolai Gilles räkenskaper behandlas.

I ett arbete av Henrik Schuck “Stockholm vid fjortonhundratalets slut” finns Nicolai Gille omtalat på flera ställen. Bland annat omnämns, att detta gille hade egen gillestuga och i bykyrkan ett eget altare och sin egen kaplan.